GEO芯片联合网络药理学探...狼疮作用机制及核心靶点分析 孟祥文.pdf

网络首发时间：2022-05-18 09:13:22
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XXXX 年 XX 月第 XX 卷第 XX 期 中国中医药信息杂志 ·1·
中医药信息学
GEO芯片联合网络药理学探究六味地黄丸治疗系统性红斑狼疮
作用机制及核心靶点分析
孟祥文 1，贾晓益 1，陆志远 1，程芷洛 1，谭亚楠 1，张敏 2
1.安徽中医药大学药学院，安徽 合肥 230012；2.中国科学技术大学附属第一医院，安徽 合肥 230001
摘要：目的 运用网络药理学及生物信息学探究六味地黄丸治疗系统性红斑狼疮（SLE）作用机制，并
对核心靶点基因进行深入分析。方法 利用 TCMSP、SwissTargetPrediction、HERB 数据平台检索六味地黄丸
的主要活性成分及其相关靶点，通过R软件limma包对GEO平台SLE数据集GSE49454进行差异分析。利用R
软件VennDiagram包进行交集靶点分析，clusterProfiler包对交集靶点基因进行GO和KEGG通路富集分析。采
用 Cytoscape3.8.2 软件进行活性成分-靶点-通路网络构建与分析。通过 STRING 平台构建蛋白相互作用网络并
利用Cytoscape3.8.2筛选核心靶点基因。利用PyMOL软件对核心活性成分与核心靶点基因进行分子对接验证；
通过临床数据与 TRRUST 数据库进行表达量、转录因子与免疫浸润分析。结果 共筛选出有效活性成分 69
个，相关靶点 813 个，基因芯片差异基因 703 个；KEGG 通路分析显示，主要涉及 NOD 样受体等信号通路；
筛选出 5 个核心成分（槲皮素、山柰酚、海风藤***、玉兰脂素 B、羟基芫花素）及 5 个核心靶点基因（TLR4、
CCL2、PTPRC、CXCL10、MPO）；分子对接显示，核心成分与核心靶点之间均具有稳定的结合能力；探寻